|
|
|
Семинар отдела Вычислительной математики
[ ] Развитие комплекса алгоритмов и программ сравнения символьных последовательностей в задачах прикладной биоинформатики
вторник, 23 июня 2026 г., 14:30, кабинет 434 ИВМ СО РАН
Шехова Анна Андреевна
(по материалам кандидатской диссертации)
В докладе будет представлен комплекс алгоритмов, позволяющих для двух символьных последовательностей локализовать участки с большим (значимым) количеством совпадений с учетом точечных замен, вставок и выпадений подпоследовательностей символов. Алгоритмы реализованы в комплекс программ, результатом работы которого является набор параметров, описывающих схожесть сравниваемых символьных последовательностей, а также их выравнивание. Алгоритмы апробированы на задаче поиска транспозонов в хлоропластах растений и задаче определения таксономического положения бактерий, гены которых секвенированы из микробиоты доноров.
[ ]
|